FAST5 数据格式

https://github.com/nanoporetech/fast5_research

https://blog.csdn.net/Emmett_Bioinfo/article/details/113847543

https://zhuanlan.zhihu.com/p/137069950

FAST5格式（.fast5）实际上是在HDF5格式上的一种变体。HDF是Hierarchical Data Format的首字母缩写，从名字上就可以看出来这种文件格式储存信息的方式是层级嵌套的（hierarchical, nested）。它采用chunking（分解）的方式来存储多维数据，它内部表现出来的是类似于文件夹（树）的结构。由于这种文件层级分解的特性，想要获取某一部分信息，只需要获得该部分信息所在的chunk即可，这样就让这种文件格式非常的flexible，也非常适合用于多种编程语言来处理。FAST5格式是Oxford推出Nanopore测序之后在HDF5格式的基础上设计用于存储Nanopore测序信息的文件。